Biorxiv: 【MIT】新肽：新冠病毒别出去！

近日，斯坦福大学的有机化学家团队设计了一种候选抗生素，他们视为这可能会企图亚型带入人亚基质的潜能。3月19日预印本网站biorxiv上报告了其初步推断出。他们已将该多肽样品送出了开发计划在人体亚基质中会透过检验的Andrea。

这种潜在的抗生素是一种亚基质的粗亚基质图片或多肽，好像像人类亚基质表面会的一种亚基质。科学研究其他部门真是明了，他们的一新多肽可以联结亚型亚基朋友们带入人体亚基质，人口为129人慢慢剿灭它。

离子靶向

在中会国的一个科学研究小组发表了冷冻电镜下亚型刺突亚基的的结构及其联结的人类亚基质激素之前，斯坦福大学化学副教授布拉德·彭特伊泽尔（Brad Pentelute）的实验室于3下半年开始投身于该项目。亚型，都有避免举例来说COVID-19爆发的SARS-CoV-2，在其病毒包膜上突出了许多亚基质尖峰。

对SARS-CoV-2的科学研究还真是明了，刺突亚基的特定周围（统称激素联结具体来说）与统称血管冷淡素转换酶2（ACE2）的激素联结。该激素普遍存在于许多人类亚基质的表面会，都有肺中会的亚基质。ACE2激素也是避免2002-03年的SARS爆发的亚型常用的切入点。

为了开发能企图病毒带入的抗生素，Pentelute实验室的博士后张根为（Gengen Zhang）对ACE2激素和亚型刺突亚基激素联结具体来说之间的交互作用透过了计算机各种类型。这些各种类型揭示了激素联结结构具体来说附着于ACE2激素的位置——ACE2亚基的一段跨越，产生了统称α棒状的结构。

张根为真是，“这种各种类型可以使我们了解离子和生物离子如何交互作用，以及哪些部分对于这种交互作用至关重要。离子动力学帮助我们缩小了我们要专注于发展治疗方法有的特定周围的范围。”

斯坦福大学的科学研究小组随后常用了Pentelute实验室先前开发的多肽人工合成技术，以快速生成与ACE2激素的α棒状序列相同的23个的多肽。他们的台式基于流动的多肽人工合成机，可以在约37秒内产生和亚基质的组成部分之间的元数据，并且用不到一个小时均可生成涵盖多达50个的清晰多肽离子。

（A） 在200 六倍的离子动力学各种类型之前，SBP1的RMSD与SARS-CoV-2-RBD终端。

由于斯坦福大学这些年来建立的工具，科学研究其他部门从前才能建立这些平台。他们还人工合成了仅在α棒状中会推断出的12个的粗序列，然后常用斯坦福大学的生物化学仪器设施的设备检验了这两种多肽，该设备可以测量两个离子联结在朋友们的准确度。他们推断出，极粗的多肽段与COVID-19刺突亚基的激素联结具体来说很强强联结力，而粗的多肽段则可忽略不计。

一新多肽的多种变体

尽管自3月春季以来，斯坦福大学一直在缩减校内科学研究，但Pentelute的实验室获得了特殊许可证，允许一小部分科学研究其他部门继续投身于该项目。他们从前正在开发该多肽的约100种不同变体，以期提高其联结准确度并使其在体内愈来愈稳定。

科学研究其他部门表示很有信心，能够确切地告诉该离子在哪里交互作用，然后可以依靠这些信息进一步监督小型化，这样有望获得愈来愈高的亲和力和愈来愈大的潜能来企图病毒带入亚基质。

同时，科学研究其他部门不太可能将其值得注意的23个多肽连到西奈山伊坎该大学的科学研究实验室，用于在人亚基质中会以及可能在COVID-19感染的动物模型中会透过检验。

尽管世界各地数十个科学研究小组正在常用各种方法有来四处寻找COVID-19的一新疗法，但Pentelute视为他的实验室是目前为此目的研制出多肽类抗生素的少数实验室之一。这种抗生素的一个优点是它们相对容易大量生产厂。它们还很强比小离子抗生素愈来愈大的表面会积。

Pentelute真是：“多肽是相当大的离子，因此它们可以真正紧紧抓住亚型并抑制亚基质带入，而如果常用的是小离子，则很难切断病毒正在常用的整个周围。病原体还很强更大的表面会积，因此它们也可能是有用的，只需花愈来愈长的整整来制造和推断出。”

多肽类抗生素的一个实用性是它们通常不会口服，因此须要静脉注射或皮射。这还需进一步修订，以便它们可以在血液中会停留足够长的整整，这样才能愈来愈直接。Pentelute的实验室也在努力尝试。

科学研究其他部门表示，很难预测只能在患儿身上透过检验的整整有多长，但其目标是要在几周内完成检验。如果结果愈来愈具挑战性，则可能要花几个月的整整。

值得注意注解：

G. Zhang et al. The first-in-class peptide binder to the SARS-CoV-2 spike protein， bioRxiv (2020). DOI： 10.1101/2020.03.19.999318.