Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的实际上

2022-01-10 02:38:35 来源:
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导言:在早期阶段,自然界就开始了在不彻底改变酵母菌蛋白DNA组织依次的前提下来使其DNA发挥完全相近的功能,而这就是通过给DNA亚基上添加化学标有来实现的。DNA甲基化是类动物的关键表型基因机制,其之前5-甲基胞嘧啶(5mc)是最典型的DNA剪裁之一。6mdA是酵母菌限制性剪裁管理系统的基本都是由掺入,现今在类动物之前依赖已确定的限制性剪裁管理系统。先前有不少研究工作引述,6mdA也;也定于类动物之前,但并无证据支持。

近日,在《科学进展》上的一项研究工作之前,瑞典林雪平所大学的研究工作医护人员断定,类动物蛋白之前;也定酵母菌表型基因标有很可能被污染了,并且无法所需的证据来断定类动物之前;也定这种剪裁。

N6-甲基腺嘌呤(6mdA)是酵母菌之前广泛的DNA剪裁,但最近在类动物DNA之前也赢取了也就是说是。然而,研究工作医护人员曾说是,即使对来自相近类动物蛋白型式的DNA进行的6mdA谱图和丰度测量研究工作也不一致。

为了更进一步阐明6mdA在类动物谱系设计标准之前的作用,研究工作医护人员利用了体外将人类文明幼稚T辅助(NTH)蛋白分化为TH蛋白亚群的能力。但是,与先前的研究工作相反,他们辨认出TH分化过程之前6mdA的丰度无法简而言之变化,并且掩蔽到分化的T蛋白之前的6mdA高度与未甲基化的全基因组缩减到DNA相近,这断定6mdA并未以可检测的高度;也定人类文明T蛋白之前。

他们还统计分析了从六个人类文明蛋白系之前制备的DNA之前的6mdA,并鉴定出两个具高于背景噪声高度的6mdA高度的蛋白系。出乎意料的是,两种单独的293T蛋白系培养物具完全相近的6mdA高度,这断定研究工作医护人员掩蔽到的6mdA回波并非蛋白型式本身固有的。毕竟,当他们更进一步看时,他们辨认出两条6mdA高度上升的蛋白系被支原体分属污染,支原体分属一种典型的酵母菌蛋白培养物之前富含6mdA的污染物。当他们用支原体甲基化口服Plasmocin处理蛋白系时,6mdA回波降低为A阴性对照。

“我们意识到通过这些技术检测到的6mdA'回波'只是噪声。但是,由于一些比较简单的技术问题,几种方法之前的背景噪声不是随机的,而是真实回波。”高级作者Colm Nestor(科尔兹·内斯特)在一份声明之前说是。

研究工作医护人员统计分析了以前通过DNA免疫沉淀测序、核磁共振和单分子实时测序在类动物蛋白之前有别于或检测6mdA的努力。人们辨认出每种方法都有局限性或缺陷,使表型基因标有的;也阳性辨认出数万人很高,似乎断定林雪平研究工作医护人员并不认为不;也定这种现象的证据。

这组作者曾说是:“我们断定,RNA和酵母菌污染、突变一个大中间体性和其他技术限制的结合已随之而来6mdA在类动物DNA之前的一再错误识别。随着DNA和RNA剪裁家族的大大增长速度,以及以前未确定剪裁的丰富性更加有名,即使适用多种互补方法,我们也强调了错误辨认出的有可能。我们决定适用剪裁和未剪裁的基因组DNA标准作为今后对稀有DNA剪裁的研究工作的平均要求,以及在适用前更全面地验证突变甲基化。”

内斯特足量说是,研究工作医护人员在研究工作非常有名的现象时必须非常不慎,选择适用哪种方法,并考虑他们是否只不过在取决于;也定的一个人。他说是:“现在我们可以毫无疑问地说是类动物之前不;也定6mdA。关于6mdA,如果研究工作医护人员停止研究工作真正不;也定的进去,则可以节省时间大量时间和金钱,并且消除了很多实在太失望的事情。”

类似中有:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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